آنالیز پروتئوم یک سویه ایرانی (nigeb-088) زانتوموناس سیتری در شرایط آزمایشگاهی

باکتری xanthomonas citri subsp. citri (xcc)، عامل بیماری شانکر آسیایی مرکبات می¬باشد که از بیماری¬های خسارت¬زا در بسـیاری از کشور¬های تولیدکننـده مرکبـات از جمله ایـران محسـوب می¬گردد. از اهداف بسیار مهم از گذشته تا به حال در زمینه بیماری¬شناسی مولکولی گیاهان، شناسایی عوامل دخیل در بیماری¬زایی می¬باشد، تا از این طریق راهی برای کنترل و ریشه¬کن کردن بیماری بیابیم. در این مطالعه از روش پروتئومیکس به¬منظور شناخت تفاوت-های ژنتیکی و اختصاصیت میزبانی سویه¬های تیپ a و a* در محیط تغذیه¬ای محدود (محیط کشت mm1) و محیط غنی (محیط کشت yp) استفاده شده است. بررسی پروتئین¬‎های بیماری‎زا در این باکتری با محدودیت زیادی روبرو است و در مقایسه با مطالعه ژنوم بر روی این پروتئین ¬ها و مخصوصاً پروتئین¬‎های ترشحی آن مطالعه کمتری صورت گرفته است. با کشت باکتری در یک محیط القایی فاقد فعالیت پروتئولیتیکی، پروتئین‎¬ها به درون محیط ترشح می¬شوند آن‎گاه می‎توان با بررسی پروتئوم خارج سلولی پروتئین¬‎های افکتور را شناسایی و مورد بررسی قرار داد. همچنین با استخراج پروتئین¬های سیتوزولی و غشایی می¬توان تغییر در بیان این پروتئین¬ها را نیز بررسی نمود و برای مقابله با بیماری تصمیم مناسب اتخاذ کرد. نتایج نشان می¬دهند که علی¬رغم وجود پروتئین¬های مشابه در پروفایل پروتئین¬های سیتوپلاسمی، غشایی و به¬ویژه ترشحی سویه¬های مورد مطالعه، تفاوت¬های معنی¬داری نیز در میان آن¬ها در شرایط مذکور دیده می¬شود. امید است که بتوان با شناسایی پروتئین¬های دخیل در بیماری¬زایی گامی در راستای پیشگیری و درمان این بیماری برداشت.